לעיתים קרובות ישנם זיהומים רבים במים טבעיים, ביניהם העיקריים המשפיעים על הדוד הם: חומר מרחף, חומר קולואידי וחומר מומס.
1. חומרים מרחפים וחומרים נפוצים מורכבים משקעים, גופות של בעלי חיים וצמחים, וכמה אגרגטים מולקולריים נמוכים, שהם הגורמים העיקריים שהופכים את המים לעכורים. כאשר זיהומים אלה נכנסים למחליף היונים, הם מזהמים את שרף ההחלפה ומשפיעים על איכות המים. אם הם נכנסים ישירות לדוד, איכות הקיטור תתדרדר בקלות, תצטבר לבוץ, תחסום את הצינורות ותגרום להתחממות יתר של המתכת. ניתן להסיר מוצקים מרחפים וחומרים קולואידים באמצעות טיפול מקדים.
2. חומרים מומסים מתייחסים בעיקר למלחים וכמה גזים המומסים במים. מים טבעיים, מי ברז שנראים טהורים מאוד, מכילים גם מלחים מומסים שונים, כולל סידן, מגנזיום ומלח. חומרים קשים הם הגורם העיקרי לזיהום בדוד. מכיוון שאבנית מזיקה מאוד לדודים, הסרת קשיות ומניעת אבנית היא המשימה העיקרית של טיפול במי הדוד, שניתן להשיג באמצעות טיפול כימי מחוץ לדוד או טיפול כימי בתוך הדוד.
3. חמצן ופחמן דו-חמצני משפיעים בעיקר על ציוד דוד הגז המומס, מה שגורם לקורוזיה של חמצן וקורוזיה חומצית בדוד. יוני חמצן ומימן הם גם דה-פולריזטורים יעילים יותר, המאיצים את הקורוזיה האלקטרוכימית. זהו אחד הגורמים החשובים הגורמים לקורוזיה של הדוד. ניתן להסיר חמצן מומס באמצעות דה-אורורטור או הוספת תרופות מחזרות. במקרה של פחמן דו-חמצני, שמירה על pH ובסיסיות מסוימים של מי הסיר יכולה לבטל את השפעתם.