โดยทั่วไปแล้ว เพื่อให้แน่ใจว่ามีประสิทธิภาพในการให้ความร้อนและลดระยะเวลาการฆ่าเชื้อ อุณหภูมิการฆ่าเชื้อยิ่งสูง เวลาการฆ่าเชื้อที่จำเป็นก็จะยิ่งสั้นลง การตรวจจับอุณหภูมิไอน้ำมักมีความไม่สม่ำเสมอในระดับหนึ่ง ในเวลาเดียวกัน การตรวจจับอุณหภูมิก็มีฮิสเทอรีซิสและความเบี่ยงเบนในระดับหนึ่ง เมื่อพิจารณาว่าอุณหภูมิและความดันของไอน้ำอิ่มตัวนั้นมีความสอดคล้องกันแบบหนึ่งต่อหนึ่ง เมื่อเทียบกันแล้ว การตรวจจับความดันไอน้ำจะสม่ำเสมอและรวดเร็วกว่า ดังนั้น ความดันไอน้ำในการฆ่าเชื้อของเครื่องฆ่าเชื้อจึงใช้เป็นพื้นฐานในการควบคุม และการตรวจจับอุณหภูมิในการฆ่าเชื้อจะใช้เป็นหลักประกันความปลอดภัย
ในทางปฏิบัติ อุณหภูมิไอน้ำและอุณหภูมิการฆ่าเชื้อบางครั้งอาจต่างกัน ในแง่หนึ่ง เมื่อไอน้ำมีน้ำควบแน่นมากกว่า 3% (ความแห้งคือ 97%) แม้ว่าอุณหภูมิไอน้ำจะถึงมาตรฐานก็ตาม เนื่องจากการอุดตันของการถ่ายเทความร้อนโดยน้ำควบแน่นที่กระจายอยู่บนพื้นผิวของไอน้ำ ในผลิตภัณฑ์ อุณหภูมิไอน้ำที่ผ่านฟิล์มน้ำควบแน่นจะลดลง ลดลงทีละน้อยเพื่อให้อุณหภูมิการฆ่าเชื้อจริงของผลิตภัณฑ์ต่ำกว่าข้อกำหนดอุณหภูมิการฆ่าเชื้อ โดยเฉพาะน้ำในหม้อไอน้ำที่ส่งผ่านโดยหม้อไอน้ำ คุณภาพน้ำอาจปนเปื้อนผลิตภัณฑ์ที่ผ่านการฆ่าเชื้อ ดังนั้น จึงมักจะมีประสิทธิภาพมากในการใช้เครื่องแยกไอน้ำและน้ำ Watts DF200 ที่ทางเข้าไอน้ำ
ในทางกลับกัน การมีอากาศอยู่จะส่งผลเพิ่มเติมต่ออุณหภูมิการฆ่าเชื้อของไอน้ำ เมื่ออากาศในตู้ไม่ถูกกำจัดออกหรือกำจัดออกไม่หมด ในทางกลับกัน การมีอากาศอยู่จะทำให้เกิดจุดเย็น ทำให้ไม่สามารถฆ่าเชื้อผลิตภัณฑ์ที่ติดอยู่กับอากาศได้ ในทางกลับกัน การควบคุมความดันไอเพื่อควบคุมอุณหภูมิ การมีอากาศอยู่จะสร้างความดันบางส่วน ในเวลานี้ ความดันที่แสดงบนมาตรวัดความดันคือความดันรวมของก๊าซผสม และความดันไอน้ำจริงจะต่ำกว่าข้อกำหนดความดันไอน้ำในการฆ่าเชื้อ ดังนั้น อุณหภูมิไอน้ำจึงไม่ตรงตามข้อกำหนดอุณหภูมิการฆ่าเชื้อ ส่งผลให้การฆ่าเชื้อล้มเหลว
ความร้อนสูงเกินของไอน้ำเป็นปัจจัยสำคัญที่มีผลต่อการฆ่าเชื้อด้วยไอน้ำ แต่หลายครั้งมักถูกมองข้าม EN285 กำหนดว่าความร้อนสูงเกินของไอน้ำที่ใช้ในการฆ่าเชื้อไม่ควรเกิน 5°C หลักการของการฆ่าเชื้อด้วยไอน้ำอิ่มตัวคือ ไอน้ำจะควบแน่นเมื่อผลิตภัณฑ์เย็นลง ซึ่งจะปลดปล่อยพลังงานความร้อนแฝงจำนวนมาก ซึ่งจะทำให้ผลิตภัณฑ์มีอุณหภูมิเพิ่มขึ้น เมื่อควบแน่น ปริมาตรจะลดลงอย่างรวดเร็ว (1/1600) และยังสามารถสร้างแรงดันลบในพื้นที่ ทำให้ไอน้ำที่ตามมาเข้าไปลึกภายในผลิตภัณฑ์ได้
คุณสมบัติของไอน้ำร้อนจัดเทียบเท่ากับอากาศแห้ง แต่ประสิทธิภาพการถ่ายเทความร้อนจะต่ำกว่า ในทางกลับกัน เมื่อไอน้ำร้อนจัดปล่อยความร้อนที่รู้สึกได้ออกมาและอุณหภูมิลดลงต่ำกว่าจุดอิ่มตัว การควบแน่นจะไม่เกิดขึ้น และความร้อนที่ปล่อยออกมาในเวลานี้จะน้อยมาก การถ่ายเทความร้อนไม่เป็นไปตามข้อกำหนดในการฆ่าเชื้อ ปรากฏการณ์นี้เห็นได้ชัดเมื่อความร้อนสูงเกินไปเกิน 5°C นอกจากนี้ ไอน้ำร้อนเกินไปยังทำให้สิ่งของเสื่อมสภาพอย่างรวดเร็วได้อีกด้วย
หากไอน้ำที่ใช้เป็นไอน้ำเครือข่ายความร้อนที่ใช้ในการผลิตไฟฟ้า ไอน้ำดังกล่าวจะเป็นไอน้ำร้อนจัด ในหลายกรณี แม้ว่าหม้อไอน้ำแบบแยกส่วนจะผลิตไอน้ำอิ่มตัว แต่การคลายแรงดันไอน้ำที่ด้านหน้าเครื่องนึ่งฆ่าเชื้อจะเป็นการขยายตัวแบบอะเดียแบติกชนิดหนึ่ง ทำให้ไอน้ำอิ่มตัวเดิมกลายเป็นไอน้ำร้อนจัด ผลกระทบนี้จะปรากฏชัดเมื่อความแตกต่างของความดันเกิน 3 บาร์ หากความร้อนสูงเกิน 5°C ควรใช้เครื่องไอน้ำอิ่มตัวแบบอ่างน้ำวัตต์เพื่อขจัดความร้อนสูงเกินในเวลาอันควร
การออกแบบไอน้ำของเครื่องนึ่งฆ่าเชื้อประกอบด้วยช่องทางเข้าไอน้ำพร้อมตัวกรองไอน้ำพิเศษ เครื่องแยกไอน้ำและน้ำประสิทธิภาพสูง วาล์วควบคุมแรงดันไอน้ำ และกับดักไอน้ำ